466 artículos
Este artículo presenta DDGeoSSE, un modelo generativo de diversificación filogenética que utiliza aprendizaje profundo para inferir cómo la riqueza de especies local modula las tasas de especiación, extinción y dispersión, demostrando su utilidad en el análisis de lagartijas *Anolis* y plantas *Viburnum*.
Este estudio demuestra que la duplicación del genoma en teleósteos generó pares de genes *omp* redundantes que, tras 300 millones de años de evolución, han diversificado la maquinaria de señalización olfativa mediante procesos de no-funcionalización y sub-funcionalización, todo ello moldeado por restricciones de equilibrio de dosis génica.
Este estudio presenta un método de paleoproteómica dirigida de alto rendimiento utilizando espectrometría de masas MALDI-CASI-FTICR para estimar el sexo biológico de individuos medievales de la Gran Moravia, logrando una mayor precisión y eficiencia que las técnicas osteomorfológicas tradicionales.
Este estudio demuestra que en los búhos lechones (*Tyto alba*) la tasa de mutaciones es de 5.6 x 10⁻⁹, que los padres transmiten el doble de mutaciones que las madres y que el número de mutaciones aumenta con la edad paterna, proporcionando la primera evidencia directa de senescencia germinativa en aves.
Este estudio demuestra que la selección dependiente de la frecuencia negativa mantiene la variación genética en la calidad de los simbiontes en la mutualismo leguminosa-rizobio, permitiendo la coexistencia de cepas de alta y baja calidad y asegurando la resiliencia evolutiva de esta interacción clave frente a cambios ambientales.
Este estudio demuestra que, para inferir el tiempo hasta la fijación de barridos selectivos duros en datos genotípicos de una sola población, los modelos de aprendizaje automático que procesan datos crudos no superan a los métodos basados en estadísticas de resumen tradicionales, lo que sugiere que quedan pocos señales no descubiertas para distinguir entre el tiempo de fijación y la edad del barrido.
Este estudio presenta un marco analítico de dos escalas temporales que demuestra cómo los elementos retrotranscriptores generadores de diversidad (DGR) confieren una ventaja evolutiva en entornos cambiantes al permitir una diversificación rápida y dirigida de regiones genómicas específicas, superando a la mutagénesis estándar y explicando su prevalencia en bacterias como las del intestino humano.
Este estudio desafía la hipótesis de que la dieta agrícola impulsó la evolución del número de copias del gen AMY1 en humanos, demostrando que la historia demográfica y la ascendencia compartida son los principales factores que explican la variación global observada.
Este estudio identifica que la levadura *Kluyveromyces marxianus* posee una tolerancia única al calor y estrés químico, resultado de millones de años de evolución que moldearon adaptativamente sus transportadores de membrana, el procesamiento de lípidos y la función de la membrana celular.
Este estudio reevalúa la evidencia de codiversificación en las simbiosis micorrícicas y concluye que, aunque existe una señal cofilogenética significativa donde plantas y hongos relacionados interactúan, la falta de congruencia filogenética indica que no hubo codiversificación, sino una coevolución difusa impulsada por el emparejamiento de rasgos.
Este estudio demuestra que los cuellos de botella funcionales en la evolución de proteínas pueden surgir de la heterogeneidad en los efectos mutacionales dentro de un modelo simple de epistasis global, sin necesidad de complejas redes de interacciones entre residuos.
Este estudio presenta un modelo generalizable que deriva expectativas analíticas para la acumulación de uniones de ascendencia en genomas mezclados, demostrando mediante simulaciones y datos empíricos que la combinación de tasas de recombinación, heterocigosidad de ascendencia y tamaño poblacional permite predecir con precisión los patrones de mezcla sin necesidad de separar las fuentes parentales.
Este estudio integra análisis genómicos y epigenéticos en el maní y sus progenitores diploides para revelar que, aunque la mayoría de las regiones de cromatina accesible se mantienen estables tras la poliploidización, la aparición de nuevas regiones y las variaciones en la accesibilidad de las regiones conservadas impulsan la evolución específica de linaje y el sesgo en la expresión de los homeólogos.
Este estudio identifica nueve inversiones cromosómicas putativas en poblaciones silvestres del erizo de mar púrpura (*Strongylocentrotus purpuratus*), de las cuales tres muestran señales de adaptación local, demostrando así que las variantes estructurales son un componente fundamental de la variación genética que facilita la adaptación en especies marinas con alto flujo génico.
Un análisis de 47 años en una población de carboneros comunes en el Reino Unido revela que la disminución a largo plazo en la masa corporal de los adultos se debe a la plasticidad fenotípica impulsada por efectos de arrastre del entorno temprano, específicamente la competencia intra e interespecífica, más que a cambios en la temperatura o en la disponibilidad de alimento.
Este estudio demuestra que la esponja *Spongilla lacustris* utiliza un sistema de señalización monoaminérgica ancestral, que implica la síntesis de monoaminas y la activación de vías de señalización intracelular, para coordinar la contracción de sus canales sin necesidad de neuronas ni músculos.
TriMouNet es un algoritmo que infiere redes filogenéticas de nivel 1 a partir de distribuciones de árboles genéticos multilocus, combinando trinets estadísticamente soportados para identificar reticulaciones con baja tasa de falsos positivos, superando así las limitaciones de métodos como TriLoNet que aplican concatenación de loci.
Este estudio demuestra que la autofecundación dependiente de la condición, donde los individuos con mayor calidad se autofecundan y los de menor calidad cruzan, es favorecida por la selección natural, generando variación dentro de la población y contribuyendo al mantenimiento de sistemas de apareamiento mixtos.
Este estudio identifica las firmas transcriptómicas neuronales y sensoriales que subyacen a las diferencias naturales en el aprendizaje de preferencias de pareja entre dos subespecies de *Heliconius melpomene*, sugiriendo que la selección sobre estos genes podría impulsar el aislamiento reproductivo y la especiación.
Este estudio demuestra que en los monos vervet salvajes, las diferencias de sexo en el desarrollo social y la supervivencia surgen principalmente de la inversión materna postnatal y el entorno social temprano más que de la asignación de sexos al nacimiento, donde la edad de la madre influye en la proporción de sexos y el rango materno afecta más fuertemente la supervivencia e integración social de las hijas que la de los hijos.